بیشترین فعالیت پژوهشی انجمن تاکنون، بیان اعجاز علمی قرآن بوده است. تاکنون 40 اشارت علمی قرآن از بین 200 پیشنهاد، غربال شده و مورد بررسی قرار گرفته است.
40 اشارت علمی قرآن
| عنوان اشاره علمی | آیه محوری | تخصص علمی | توضیح | |
| 1 | ذات الرجع بودن آسمان | آیه 11 سوره طارق | هواشناسی،کیهان شناسی | چرخه آب و باد و هوا و اقلیم، حرکت رجعی سیارات |
| 2 | رواسی بودن کوه ها و مد الارض | آیه 15 سوره نحل | زمین شناسی | فرآیند شکل گیری کوهها و جلوگيری از لرزش و ایجاد آرامش در پوسته زمين |
| 3 | لواقح بودن و تصریف بادها | آيه 22 سوره حجر | هواشناسی، گیاه شناسی | بارورسازی ابرها و گیاهان توسط باد |
| 4 | ظلمات ثلاث جنین | آیۀ 6 سوره زمر | جنین شناسی | سه تاریکی درون رحم و لایه‌های سه‌گانة پوشانندة جنین |
| 5 | سقف محفوظ بودن آسمان | آیه 32 سوره انبیاء | هواشناسی | نقش حفاظتی جو زمین |
| 6 | شجره مبارکه زیتون و اشتعال سریع روغن آن | آیه 35 سوره نور | گیاه شناسی | |
| 7 | فتح مکه | سوره نصر | تاریخ شناس | خبر غیبی قرآن |
| 8 | خانه‌سازی و تولید عسل توسط زنبور ماده | آیه 68 سوره نحل | حشرهشناس | الهام غریزی، خانه‌سازی؛ مکیدن شهد گل‌ها؛ پیمودن مسیر راه تا رسیدن به کندو و تهیه عسل |
| 9 | حرکت خورشید به محل استقرارش | آیه 38 سوره یس | کیهان شناس | |
| 10 | تقدم سمع بر بصر | آیه 78 سوره نحل | جنین شناسی | |
| 11 | خوردن رطب حین زایمان | آیه 25 سوره مریم | متخصص تغذیه | |
| 12 | تغیض و تزداد رحم | آیه 8 سوره رعد | جنین شناسی | |
| 13 | تقدم فاکهه بر لحم برای بهشتیان | آیه 20 سوره واقعه | متخصص تغذیه | تقدّم ميوهها بر گوشت پرنده |
| 14 | نعمت ضلال و سرابیل حافظ از حر و باس | آیه 81 سوره نحل | جو زمین، حفظت کننده از خورشید | |
| 15 | پدید آمدن هرچیز زنده از آب | آیه 30 سوره انبياء | زیست شناس | |
| 16 | خواب طولانی و زخم بستر | آیه 17 سوره کهف | ||
| 17 | خلق هفت آسمان و همانند آن‌ها از زمين | آیه 12 سوره طلاق، | ||
| 18 | تکویر شب بر روز و روز بر شب | آیه 5 سوره زمر | کرویت زمین | |
| 19 | تاریکی‌های بحر لجی | آیه 40 سوره نور | اقیانوس شناسی | |
| 20 | محو آیه لیل و مبصر قرار دادن آیه روز | آیه 12 سوره اسراء | کیهان شناس | خاموش شدن ماه |
| 21 | زنده شدن زمین خشک | آیه 5 سوره حج | ||
| 22 | گسترش دابه در آسمانها و زمین | آیه 29 سوره شوری | کیهان شناس | حیات در کرات دیگر |
| 23 | عدم امکان بازپس گیری آنچه ذباب برباید | آیه 73 سوره حج | حشره شناس، | |
| 24 | صعود ملائکه و روح در روزی به اندازه 50000 سال | آیه 4 سوره معارج | فیزیک | اتساع زمان |
| 25 | امر در روزى كه مقدارش هزار سال است، به سوى او صعود می کند. | آیه 5 سوره سجده | کیهان شناس | |
| 26 | قمر نور و خورشید سراج است | آیه 5 سوره یونس | نور ماه، بازتاب نور خورشید | |
| 27 | رابطه رواسی شامخات با آب فرات | آیه 27 سوره مرسلات | هواشناس | ارتفاعات بلند عامل ریزش باران |
| 28 | حرکت ابرمانند کوه ها | آیه 88 سوره نمل | زمین شناس | |
| 29 | تکلم مورچگان | آیه 18 سوره نمل | حشره شناس | |
| 30 | عذاب از راه پوست | آیه 56 سوره نساء | سوزاندن پوست مجرمان و تبدیل پوستهای سوخته به صورت اولیه شان برای چشیدن درد | |
| 31 | نگهداری 7 ساله غلات | آيه 47 سوره يوسف | کشاورزی | هرچه می دروید درخوشه اش گذارید |
| 32 | بحر مسجور | آیه 6 سوره طور | زمین شناس | آتشفشان های قعر دریا |
| 33 | نقش برق در بارندگی و رشد گیاه | آیه 24 سوره روم | هواشناس | |
| 34 | بقایای کشتی نوح | آیه 15 سوره قمر | جغرافیدان، باستانشناس | کوه آرارات ترکیه یا جودی داغ |
| 35 | رفعت سماوات بدون عمد قابل دیدن | آیه 2 سوره رعد | فیزیک | نیروی گرانش و نقش آن در پیدایش بنای رفیع آسمان |
| 36 | میخ وارگی کوه ها در زمین | آیه 7 سوره نبأ | زمین شناس | |
| 37 | عبرت انگیزی نوشاندن از بطون انعام از بین فرث و دم | آیه 66 سوره نحل | جانورشناس | ایجاد شیر در حیوانات |
| 38 | زوجیت عمومی در همه اشیای جهان | آیه 49 سوره ذاریات | جانورشناس، گیاه شناس | زوجیت گیاهان، ثمرات، حیوانات |
| 39 | تصریف ریاح (گردش بادها) | آیه 50 سوره فرقان | هواشناس | |
| 40 | ناصیه کاذبه خاطئه | آیه 15 سوره علق | روانشناس | پیشانی مرکز دروغ و گناه |
همچنین تاکنون نشست های علمی ذیل در زمینه اعجاز علمی قرآن برگزار شده است.
- مرز دو دریا
- • تکلم مورچگان
- • حدید و مغناطیس
- • بازگردش سامانه بادها
- • حرکت اجرام سماوی
- • مراحل تکوین جنین
